Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IppP28575 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IppP28575 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IppP28575 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IppP28575 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IppP28575 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IppP28575 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IppP28575 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IppP28575 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IppP28575 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IppP28575 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IppP28575 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IppP28575 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IppP28575 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IppP28575 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IppP28575 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IppP28575 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IppP28575 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IppP28575 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IppP28575 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IppP28575 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IppP28575 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IppP28575 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IppP28575 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IppP28575 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IppP28575 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IppP28575 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IppP28575 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IppP28575 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IppP28575 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IppP28575 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IppP28575 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IppP28575 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IppP28575 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IppP28575 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IppP28575 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IppP28575 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IppP28575 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IppP28575 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IppP28575 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IppP28575 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IppP28575 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IppP28575 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms