Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd9P28357 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms