Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf8P23611 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf8P23611 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf8P23611 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf8P23611 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf8P23611 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms