Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms