Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prim1P20664 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prim1P20664 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim1P20664 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prim1P20664 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prim1P20664 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prim1P20664 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prim1P20664 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms