Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RargP18911 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RargP18911 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RargP18911 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RargP18911 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RargP18911 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RargP18911 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RargP18911 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RargP18911 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RargP18911 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RargP18911 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RargP18911 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RargP18911 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RargP18911 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RargP18911 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RargP18911 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RargP18911 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RargP18911 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RargP18911 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RargP18911 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RargP18911 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RargP18911 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RargP18911 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RargP18911 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RargP18911 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RargP18911 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RargP18911 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RargP18911 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RargP18911 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RargP18911 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RargP18911 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RargP18911 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RargP18911 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RargP18911 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RargP18911 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RargP18911 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RargP18911 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RargP18911 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RargP18911 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RargP18911 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RargP18911 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RargP18911 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RargP18911 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RargP18911 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RargP18911 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RargP18911 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RargP18911 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms