Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd48P18181 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd48P18181 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms