Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptbp1P17225 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms