Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgfb3P17125 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgfb3P17125 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms