Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ass1P16460 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms