Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms