Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms