Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd1d1P11609 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd1d1P11609 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms