Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lamp1P11438 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms