Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calm1P0DP26 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calm1P0DP26 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calm1P0DP26 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms