Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna9P09235 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms