Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtaP09225 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtaP09225 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtaP09225 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LtaP09225 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LtaP09225 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LtaP09225 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LtaP09225 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LtaP09225 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LtaP09225 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LtaP09225 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LtaP09225 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LtaP09225 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtaP09225 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtaP09225 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtaP09225 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtaP09225 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtaP09225 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtaP09225 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LtaP09225 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LtaP09225 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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