Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb1P09055 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb1P09055 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms