Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa1P09022 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa1P09022 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms