Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtrP07309 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtrP07309 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtrP07309 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtrP07309 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtrP07309 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtrP07309 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtrP07309 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtrP07309 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtrP07309 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtrP07309 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms