Protein–RNA interactions for Protein: P06803

Pim1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pim1P06803 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pim1P06803 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pim1P06803 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pim1P06803 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pim1P06803 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pim1P06803 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pim1P06803 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pim1P06803 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pim1P06803 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pim1P06803 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pim1P06803 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pim1P06803 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pim1P06803 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pim1P06803 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pim1P06803 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pim1P06803 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pim1P06803 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pim1P06803 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pim1P06803 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pim1P06803 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pim1P06803 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pim1P06803 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pim1P06803 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pim1P06803 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms