Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxa4P06798 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa4P06798 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa4P06798 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms