Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn3P06796 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn3P06796 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn3P06796 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms