Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06334 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06334 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06334 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06334 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06334 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06334 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06334 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06334 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06334 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06334 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06334 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06334 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06334 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06334 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06334 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06334 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06334 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06334 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06334 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06334 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06334 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06334 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06334 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms