Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XlrP05531 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XlrP05531 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XlrP05531 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XlrP05531 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XlrP05531 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XlrP05531 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XlrP05531 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XlrP05531 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XlrP05531 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XlrP05531 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XlrP05531 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XlrP05531 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XlrP05531 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XlrP05531 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XlrP05531 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XlrP05531 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XlrP05531 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XlrP05531 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XlrP05531 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XlrP05531 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XlrP05531 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XlrP05531 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XlrP05531 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XlrP05531 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XlrP05531 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XlrP05531 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XlrP05531 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XlrP05531 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XlrP05531 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XlrP05531 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XlrP05531 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XlrP05531 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XlrP05531 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
XlrP05531 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XlrP05531 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XlrP05531 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XlrP05531 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XlrP05531 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XlrP05531 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XlrP05531 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms