Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa7P02830 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa7P02830 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms