Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-AaP01910 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-AaP01910 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms