Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01789 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01789 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01789 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01789 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01789 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01789 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01789 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01789 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01789 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01789 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01789 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01789 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01789 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01789 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01789 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01789 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01789 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01789 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01789 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01789 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01789 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms