Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01748 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01748 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01748 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01748 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01748 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01748 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01748 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01748 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01748 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01748 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01748 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01748 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01748 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01748 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01748 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms