Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01652 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01652 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
P01652 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01652 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01652 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01652 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01652 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01652 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01652 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01652 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01652 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01652 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01652 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01652 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01652 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01652 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01652 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01652 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01652 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01652 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01652 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01652 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01652 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01652 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01652 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01652 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01652 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01652 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01652 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01652 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01652 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01652 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01652 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01652 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01652 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms