Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01646 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01646 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01646 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01646 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01646 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P01646 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01646 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01646 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01646 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01646 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01646 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P01646 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01646 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P01646 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01646 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01646 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01646 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01646 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01646 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01646 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01646 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01646 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01646 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01646 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01646 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01646 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01646 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01646 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01646 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01646 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01646 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01646 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01646 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms