Protein–RNA interactions for Protein: O89023

Tpp1, Tripeptidyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpp1O89023 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpp1O89023 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpp1O89023 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms