Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MscO88940 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MscO88940 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MscO88940 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MscO88940 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MscO88940 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MscO88940 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MscO88940 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MscO88940 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MscO88940 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MscO88940 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MscO88940 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MscO88940 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MscO88940 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MscO88940 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MscO88940 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MscO88940 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MscO88940 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MscO88940 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MscO88940 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MscO88940 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MscO88940 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MscO88940 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MscO88940 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms