Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd160O88875 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd160O88875 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd160O88875 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd160O88875 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd160O88875 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd160O88875 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd160O88875 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd160O88875 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd160O88875 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd160O88875 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd160O88875 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd160O88875 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd160O88875 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd160O88875 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd160O88875 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms