Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
F11rO88792 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
F11rO88792 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
F11rO88792 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
F11rO88792 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
F11rO88792 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
F11rO88792 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
F11rO88792 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
F11rO88792 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
F11rO88792 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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F11rO88792 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
F11rO88792 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
F11rO88792 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
F11rO88792 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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