Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a3O88561 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc27a3O88561 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a3O88561 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms