Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CntfrO88507 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CntfrO88507 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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