Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbkbO88351 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbkbO88351 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms