Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nid2O88322 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nid2O88322 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nid2O88322 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nid2O88322 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nid2O88322 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nid2O88322 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nid2O88322 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nid2O88322 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nid2O88322 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms