Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx12O70493 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx12O70493 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx12O70493 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms