Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stra6O70491 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stra6O70491 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra6O70491 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms