Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtssO70370 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtssO70370 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtssO70370 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtssO70370 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtssO70370 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CtssO70370 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtssO70370 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtssO70370 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtssO70370 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtssO70370 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtssO70370 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtssO70370 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtssO70370 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtssO70370 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtssO70370 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtssO70370 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtssO70370 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtssO70370 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtssO70370 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtssO70370 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtssO70370 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtssO70370 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtssO70370 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtssO70370 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.3 ms