Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap2O55126 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms