Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms