Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bnip3O55003 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnip3O55003 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms