Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SlkO54988 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SlkO54988 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SlkO54988 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SlkO54988 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SlkO54988 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SlkO54988 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SlkO54988 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SlkO54988 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SlkO54988 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SlkO54988 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SlkO54988 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SlkO54988 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SlkO54988 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SlkO54988 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SlkO54988 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SlkO54988 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SlkO54988 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SlkO54988 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SlkO54988 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SlkO54988 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SlkO54988 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SlkO54988 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SlkO54988 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SlkO54988 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SlkO54988 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SlkO54988 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlkO54988 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlkO54988 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SlkO54988 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SlkO54988 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SlkO54988 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SlkO54988 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms