Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd2O35927 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms