Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp100O35892 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp100O35892 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp100O35892 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms