Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CaluO35887 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CaluO35887 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaluO35887 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaluO35887 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaluO35887 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaluO35887 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaluO35887 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaluO35887 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaluO35887 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaluO35887 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaluO35887 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaluO35887 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaluO35887 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaluO35887 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CaluO35887 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CaluO35887 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CaluO35887 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CaluO35887 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CaluO35887 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaluO35887 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CaluO35887 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CaluO35887 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CaluO35887 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CaluO35887 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CaluO35887 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CaluO35887 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CaluO35887 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaluO35887 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CaluO35887 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CaluO35887 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CaluO35887 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CaluO35887 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CaluO35887 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CaluO35887 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CaluO35887 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CaluO35887 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CaluO35887 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CaluO35887 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms