Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NudcO35685 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NudcO35685 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NudcO35685 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NudcO35685 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NudcO35685 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NudcO35685 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NudcO35685 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NudcO35685 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NudcO35685 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NudcO35685 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NudcO35685 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NudcO35685 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NudcO35685 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NudcO35685 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NudcO35685 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NudcO35685 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NudcO35685 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NudcO35685 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NudcO35685 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NudcO35685 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NudcO35685 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NudcO35685 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NudcO35685 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NudcO35685 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NudcO35685 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NudcO35685 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NudcO35685 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NudcO35685 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NudcO35685 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NudcO35685 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NudcO35685 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NudcO35685 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms